云南还有古老的地质历史，第三纪以后来自古南大陆的印度板块与欧亚板块相碰撞，带来了丰富的非洲等南半球植物成分。喜马拉雅的隆升及横断山的形成引起古地中海的退却，原来的一些古老的地中海植物万分在这一地区得以保存下来。加之云南大部分地区本来就是古老复杂的东亚植物区系的一部分，其南部又属热带北缘，许多典型的热带印度马来植物种类也随着河谷向北延伸至西北部的峡谷地带。在第四纪冰期时，许多北方的植物种类南迁，汇入云南。加上得天独厚的地理环境和气候条件，植物区系成分南北交流、融汇，并保存了许多孑遗植物，使得占中国土地面积仅4%的云南却拥有16000种高等植物，占中国一半以上的植物种类，成为举世瞩目的“植物王国”。

 

　　云南高山地区，特别是滇西北地区是“植物王国”中的一颗明珠。该地区山体高大，沟谷纵深，怒江、澜沧江以及金沙江南北并流，奔腾而下，形成了世界著名的三江峡谷。举世闻名的横断山区由于深受低纬度高海拔的影响，各山地垂直带呈现出相似的植被成带规律。在云南的西北高山峡谷中，植被类型依次为干旱或半干旱河谷稀树灌草丛，亚热带山地常绿阔叶林和常针叶林，湿性与寒性针叶林，高寒灌丛与草甸，高山流石滩及冰缘植被。完整的山地垂直气候带谱、复杂多样的环境条件造就了丰富多彩的高山植物。云南这一地区高等植物在5000种以上，是中国植物种类最丰富的地区，同时也是许多植物类群重要的多样化中心和著名的天然大花园。世界著名的花卉如杜鹃（Rhododendron）、报春（Primula）、龙胆（Gentiana）、马先蒿（Pedicularis）、紫堇（Corydalis）、垂头菊（Cremanthodium）等植物在这里得到充分发展。中国有杜鹃属植物530多种，有近200种分布在这里，成为高山植物的一大景观；中国300多种报春中，近100种分布于云南的横断山区；中国有龙胆属植物240余种，有110多种生长在这里；全世界约有马先蒿500余种，中国有345种，横断山区就有216种；中国有柴油堇属植物300种，约有90种分布在这一地区；中国有垂头菊属植物65种，横断山区就有35种以上；中国有蓝钟花属（Cyananthus）植物18种，13种分布于这一地区；中国30余种党参属（Codonopsis）植物中，至少有20种在这里有分布。此外，物种在这里分化十分剧烈，拥有十分丰富的特有属种、被誉为植物属种的新特有中心。中国特有种子植物属在云南有两大多样性中心，一个位于滇西北，另一个位于滇东南。滇西中心约有47个属，隶属于27个科。而且许多种系还处于不断分化中，形成许多年轻的种系。复杂的种系结构和齐全的种系进化系列为研究高山植物的起源分化提供了第一手资料。许多毛莨科（Ranunculaceae）、蔷薇科（Rosaceae）、菊科（Compositae）、虎耳草科（Saxifragaceae）、景天科（Crassulaceae）、紫葳科（Bignoniaceae）、唇形科（Labiatae）、玄参科（Scrophulariaceae）、桔梗科（Campanulaceae）、鸢尾科（Iridaceae）和兰科（Orchidaceae）等植物有相当多的种类分布在这一地区，很多种类在这一地区光彩夺目，是世界观赏植物宝贵的基因库。

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